Главная Регистрация Контакты Статистика RSS

Очень часто могут быть пропущены экзоны или неправильно определены границы гена  
  19-12-2012, 12:25  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 128  медицина

Поэтому даже если ген удается идентифицировать, очень часто могут быть пропущены экзоны или неправильно определены границы гена. Существуют примеры, когда малые гены человека были спрятаны внутри нитронов генов большего размера. Создание полного и точного каталога человеческих генов может потребовать очень много времени. Существенная проблема, возникающая на последних стадиях секвенирования, — представление данных по сиквенсу и соответствующих описаний в доступной форме. Проблема была в значительной степени преодолена в результате разработки геномных браузеров (программ просмотра). Последние осуществляют визуализацию получаемых данных и позволяют пользователю перемещаться на экране между изображениями, демонстрирующими геном с различным уровнем разрешения. Например, браузер EnsEMBL (http://www. emsembl.org/) позволяет пользователю обозревать весь геном как набор хромосом. Наведя курсор на изображение хромосомы и кликнув, пользователь может выйти на конкретный субхромосомный район и последовательно увеличить разрешение вплоть до мононуклеотидного уровня (рис. 2-8).


Чтобы хорошо отдохнуть на море в следующем году, позаботьтесь о месте вашего размещения заранее. К примеру, можете по адресу http://annamariya.com.ua/ почитать про отель "Анна Мария", который послужит идеальным местом для отдыха всей вашей семьи.
Читать далее...

Для поиска генов  
  19-12-2012, 12:23  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 80  медицина

Для поиска генов ab initio и на основании гомологии используют компьютерные программы. Это дает простор как для переоценки, так и недооценки числа генов. Например, ген может быть предсказан неверно, если последовательность обнаруживает сильную гомологию с известным геном, но на самом деле является псевдогеном (остатком нефункционирующего гена), или если предсказание было сделано на основании последовательности кДНК, которая на самом деле является артефактом (геномные последовательности могут случайно оказаться в числе кДН К-клонов во время конструирования библиотеки). В то же время истинные гены могут быть пропущены, если они экспрессируются на очень низком уровне или лишь в ограниченных клеточных популяциях (тогда они очень редко встречаются в кДНК-библиотеках). Кроме того, пропуск возможен, если характерныепризнаки гена не были узнаны компьютером (это случается с атипичными генами, например, для некодирующих РНК). Человеческие гены бывает трудно распознать, поскольку зачастую они очень большого размера, но состоят из маленьких экзонов, отделенных друг от друга огромными нитронами.


Если вы уже не можете терпеть спинные спазмы народные средства вам помогут. Главное предварительно загляните на портал spazmov.net и почитайте о каких средствах идет речь и как ими пользоваться.
Читать далее...

Аннотирование генома  
  19-12-2012, 12:14  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 114  медицина

Около 100 тыс. EST-маркеров было локализовано на карте генома путем типирования радиационных гибридов и YAC-клонов (дополнение 2-5). Конечно, не все эти последовательности представляют собой индивидуальные гены, и были предприняты попытки идентификации уникальных наборов генов путем комбинирования перекрывающихся EST (например, UniGene Project; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/). Первые достаточно полные генетические карты были получены в 1996 г., и они указывали на наличие около 20—30 тыс. генов. В то время считалось, что это очень маленькая часть каталога человеческих генов. В 2001 г., когда стала доступна последовательность генома, ожидали обнаружения существенного числа новых генов. Но ко всеобщему удивлению общее число генов оказалось гораздо меньше, чем ожидалось. По современным оценкам, в геноме человека около 30 тыс. генов, что лишь на 50% больше, чем у нематод Caernohabditis elegans. Точное число невозможно установить с полной уверенностью, поскольку некоторые гены трудно идентифицировать. Ген можно предсказать, если • существуют доказательства, что последовательность экспрессируется. • последовательность гомологична известному гену или EST (либо человека, либо других организмов). • последовательность содержит какой-то признак, например промотор, участок сплайсинга, участок полиаденилирования или нуклеотидную последовательность, позволяющую предположить существование экзона.
Каждый знает, как много сил и времени отнимает переезд на новое место жительство. Однако сегодня есть более простой и выгодный выход, это услуги разнорабочих, которые заказать можно на сайте zakaz-nnov.ru. Загляните сами, чтобы получить более подробную информацию о предоставляемых услугах.
Читать далее...

Реализации проекта HGP  
  19-12-2012, 11:49  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 84  медицина

Первая задача, возникающая после установления последовательности любого генома — это его описание (аннотирование), т. е. извлечение из имеющейся последовательности полезной биологической информации. В сущности, это означает поиск генов и их регуляторнм\ элементов, которые представляют собой функциональные компоненты генома и очень важны с точки зрения медицины. С самого начала реализации проекта HGP наибольшее внимание вызывали структурные гены, что выражалось в высокопроизводительном (массовом) секвенировании кДНК-клонов для создания больших коллекций EST-маркеров. Как уже упоминалось ранее, EST — это фрагменты кДНК длиной 100—200 п. н., полученные одноразовым секвенированием клонов, случайным образом выбранных из библиотек кДНК (в то время как для получения окончательной версии последовательности ее секвенируют 8—10 раз). Следовательно, будучи короткими и не совсем точными, EST обеспечивают быстрый и недорогой путь к идентификации последовательностей генов, а кроме того, они являются полезными маркерами при физическом картировании.


Когда мне нужно посмотреть значение какого-либо термина, я всегда пользуюсь порталом fintermin.ru. К примеру, никогда не знал точно, что такое вальвация. Теперь знаю)
Читать далее...

Клон за клоном  
  19-12-2012, 11:12  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 108  медицина

Метод дробовика ≪клон за клоном≫ и полногеномный метод сравниваются на рис. 2-6. В целом метод ≪клон за клоном ≫ не такой быстрый из-за необходимости предварительного картирования и упорядочивания ДНК-клонов, но он гораздо проще на завершающей стадии, так как иерархическая сборка последовательности не требует больших вычислительных ресурсов. Напротив, хотя метод дробовика для всего генома производит данные по секвенированию быстро, однако стадия сборки единой последовательности гораздо более затруднена, особенно из-за высокого содержания повторяющейся ДНК в геноме человека (рис. 2-7). Действительно, есть основания полагать, что для завершения первой, черновой, версии последовательности генома человека Celera опиралась на карты и данные по секвенированию, полученные в рамках проекта HGP (все это было в свободном доступе через Интернет). Финансируемый государственными организациями HGP и частный проект Celera сделали совместное заявление о завершении черновой версии геномной последовательности в 2000 г. (через 8 месяцев ими были опубликованы отчеты о полученных результатах в специальных выпусках журналов Nature и Science), а полностью последовательности были закончены в 2003 г.


Для контроля и управления доступом персонала в те или иные помещения или зоны используется современная система скуд. О том, где ее можно приобрести, а также узнать ориентировочную стоимость можно на тематическом портале bio-office.org.
Читать далее...

Этот подход называется методом дробовика  
  19-12-2012, 08:46  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 75  медицина

Этот подход называется методом дробовика. В рамках проекта HGP использовался ≪иерархический метод дробовика ≫: одновременное секвенирование методом дробовика нескольких фрагментов из индивидуальных ВАС-клонов. Поскольку на этой стадии проекта каждый ВАС-клон уже был картирован физически, положение последовательности на эталонной физической карте могло быть определено достаточно легко. В 1999 г. в США биотехнологическая компания Celera Genomics, финансируемая из частных фондов, предприняла попытки секвенировать человеческий геном с использованием альтернативного подхода — метода полногеномного дробовика. При таком подходе секвенирование методом дробовика проводили на всей геномной ДНК. Никакого картирования не проводилось. Вместо него использовались мощные компьютеры для сборки всего генома из прочтения коротких 600—700-звенных нуклеотидных последовательностей. Координатор проекта Крэйг Вентер использовал в 1995 г. геномный вариант метода дробовика для расшифровки первого клеточного генома. Он подтвердил применимость этого метода для сложного эукариотического генома, приняв участие в объединенном ≪частно-общественном≫ проекте по секвенированию эухроматической части генома Drosophila melanogaster (табл. 2-2).


Огромную пользу для женщин представляет особая Алтайская травка под названием боровая матка. Эта трава оказывает благоприятное действие при лечении любых гинекологических заболеваний.
Читать далее...

Существуют также маркеры экспрессируемых последовательностей  
  19-12-2012, 08:31  admin  комментариев: 0 | Просмотров: 65  медицина

Очень важно, что некоторые из STS-маркеров содержали полиморфные микросателлитные последовательности, позволяющие использовать их в качестве двойных генетических маркеров и объединять в генетической карте. Существуют также маркеры экспрессируемых последовательностей (EST — от англ. Expressed sequence tags), получаемые из клонов кДНК и, таким образом, позволяющие устанавливать положение генов. Значимость маркеров ESTs в картировании генов обсуждается ниже. Стратегия секвенирования Все проекты по расшифровке клеточных геномов базировались на фундаментальной технологии секвенирования методом терминаторов, принцип которого объясняется на рис. 2-5. Однако даже с помощью самого совершенного прибора трудно получить за одну реакцию хорошо прочитанную последовательность л. i иной более 600—700 нуклеотидов. Следовательно, чтобы определить последовательность большой вставки в ВАС- или РАС-векторе (до 200 тыс. п. н.), ее следует разбить на более короткие фрагменты, и секвенировать их по отдельности. Это обычно достигается путем случайного разрезания вставки на фрагменты длиной 1—2 тыс. п. н. Далее все данные по секвенированию вводятся в компьютер, который может искать перекрывания и снова собирать полную последовательность исходной вставки с использованием специальной программы (алгоритма), например PHRAP.


Самым простым способом найти развлечение на вечер, если вы находитесь в Израиле, это заглянуть на портал sparkclub.co.il מועדון לבת מצווה, который подскажет вам приличные ночные клубы города.
Читать далее...

Календарь
«    Декабрь 2012    »
ПнВтСрЧтПтСбВс
 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
 
Популярное
  • Игра на Mac OS
  • Бесплатная консультация диетолога
  • При незначительных кровотечениях
  • Желудочно-кишечное кровотечение
  • Химчистка шерстяных ковров
  • Применение органосохраняющих операций при лечении язвен ...
  • Селективная ваготомия
  • Существуют три основных вида ваготомии
  • Показания к оперативному лечению язвенной болезни
  • Пилородуоденальный стеноз
  • Наши партнеры
    Copyright © 2010 mymuza.ru