Скрининг проб для сиквесна Глобальное профилирование экспрессии генов методом отбора проб для сиквенса основано на простом принципе: сильно экспрессирующиеся гены дают большие количества мРНК, чем слабо экспрессирующиеся и, следовательно, будут лучше представлены в библиотеках кДНК. В таком случае секвенирование тысяч случайно взятых клонов кДНК с последующим подсчетом числа всех представленных в выборке генов дает грубую оценку относительных уровней экспрессии генов. Более того, сравнение двух библиотек кДНК (например, полученных из здоровой ткани и клинического образца, в частности, раковой опухоли) может выявить различным образом экспрессирующиеся гены, и, таким образом, идентифицировать те, что изменены в случае болезни. Метод сиквенсного сэмплинга достаточно надежен, но он трудоемок и дорогостоящ, поскольку требует крупномасштабных экспериментов. Для преодоления такого рода трудностей были разработаны варианты высокопроизводительного сиквенсного сэмплинга, и один из них, получивший наибольшее признание, — серийный анализ экспрессии генов (SAGE, от англ. serial analysis of gene expression). Принцип метода SAGE показан на рис. 2-9: простая схема скрывает сложные детали. Вместо индивидуального отбора тысяч кДНК с помощью ферментов рестрикции из каждой кДНК извлекают короткие концевые фрагменты (маркеры, tags) (8—15 нуклеотидов), и эти фрагменты соединяют (лигируют) в протяженные конкатемеры. Конкатемеры секвенируют, и поскольку каждый из них содержит фрагменты, соответствующие 50—100 молекулам кДНК, то объем данных, полученных в рамках одного эксперимента, существенно возрастает.

---

Любите путешествовать? Тогда для вас не подойдет пассивный пляжный отдых, каждый год в одно и то же место. Лучше посмотреть и купить путевку в италию. Эта страна богата на удивительные и красивейшие достопримечательности, что сделает ваш отдых незабываемым.